超凈工作臺原理是在在特定的空間內，室內空氣經預過濾器初濾，由小型離心風機壓入靜壓箱，再經空氣高效過濾器二級過濾，從空氣高效過濾器出風面吹出的潔凈氣流具有一定的和均勻的斷面風速，可以排除工作區原來的空氣，將塵埃顆粒和生物顆粒帶走，以形成無菌的高潔凈的工作環境。

超凈工作臺從操作人員數上分：分為單人工作臺和雙人工作臺；超凈工作臺從結構上分：分為常規型和新型推拉以及自循環型（僅限垂直流）。
超凈工作臺根據氣流的方向分為垂直層流超凈工作臺（vertical flow clean bench）和水平層流超凈工作臺（horizontal flow clean bench），垂直流工作臺由于風機在頂部所以噪音較大但是風垂直吹，多用在醫藥工程這樣保證人的身體健康；水平流工作臺噪音比較小風向往外所以多用在電子行業，對身體健康影響不大。
超凈工作臺根據操作結構分為單邊操作及雙邊操作兩種。按其用途又可分為普通超凈工作臺和生物（醫藥）超凈工作臺。

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